Фамилия Агачкин имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркского прозвища Агач. Фамилия Агачкин образована от прозвища Агач. В его основе лежит слово «агач» — так называлась закавказская путевая мера, приблизительно равная часу. Агачом называли также полуторный пай при дележе промысла. Согласно другой гипотезе, прозвище Агач имеет тюркские корни и восходит к слову agach, которое переводится на русский язык как «дерево».