Фамилия Агакулиев — одна из тех, что сразу выдают восточное происхождение. Её основа — составное азербайджанское или тюркское имя Агакули (Ага-Гулу). Первая часть «ага» (аğа) в тюркских языках означает «господин», «хозяин», «старший», «почтенный». Вторая часть — «кули» (qulu) — переводится как «раб», но в контексте личных имён это не унизительное прозвище, а религиозная формула: «раб Божий». Таким образом, имя Агакули означает «почтенный раб Божий» или «старший слуга Господа».

Фамилия образована по русской модели: к основе Агакули добавлен суффикс -ев, который в тюркских фамилиях заменяет более привычный -ов после мягких согласных. Это типичный случай русификации мусульманских имён в XIX–XX веках, когда при записи в метрические книги или паспорта к исконному имени прибавляли русский патронимический суффикс. Агакулиев буквально значит «сын Агакули» или «потомок Агакули».

Географически фамилия тяготеет к Азербайджану и Дагестану. В России она встречается преимущественно среди азербайджанцев, а также у лезгин и других народов Южного Дагестана, где тюркские имена с компонентом «кули» были широко распространены. В дореволюционных записях можно встретить варианты Агакули-оглы (с тюркским патронимом) или просто Агакули без суффикса.

Интересная деталь: фамилия сохранила архаичную форму имени. В современном азербайджанском языке имя Агагулу (Ağaqulu) часто произносится с твёрдым «г», но в русской записи закрепился вариант через «к» — Агакули. Это отражает старую транслитерацию, когда арабскую букву «каф» (ق) передавали как «к», хотя по звучанию она ближе к твёрдому «г». Так что написание фамилии — своего рода лингвистический снимок начала XX века.

Носители фамилии — в основном потомки людей, носивших имя Агакули. Сословно это могли быть как крестьяне, так и купцы или духовные лица: имя «ага» часто давали старшим сыновьям в уважаемых семьях, независимо от достатка. Сведений о дворянском происхождении фамилии нет — она бытовая, народная, без привязки к знатным родам.