«азганун») на армянском языке означает имя клана. Фамилия Агамалян образована от армянского мужского имени Агамал, что в переводе на русский язык означает «поле в горах». Менее вероятно, что фамилия Агамалян произошла от арабского мужского имени Агамали, которое является составным и восходит к двум тюркским словам: «ага», что в переводе на русский язык означает «господин», и «малла», то есть «светлый». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын рос умным, добрым, справедливым и честным мальчиком.