Фамилия Агажанов — типичный пример «восточной» фамилии, которая образовалась на русской почве по стандартной модели: к основе добавили суффикс -ов. В этом случае основой послужило мужское имя Агажан, популярное в тюркоязычной и персидской среде. Агажан — составное имя, где каждая часть несёт свой смысл. Первый элемент, «ага», восходит к арабскому слову со значением «господин», «старший», «хозяин». Второй элемент — «жан» (в персидском произносится как «джан») — означает «душа». Получается, что имя Агажан можно перевести как «господин души» или «дорогой господин». Это не столько описание, сколько пожелание: родители, давая такое имя, хотели, чтобы ребёнок вырос уважаемым и состоятельным человеком.

С точки зрения словообразования фамилия Агажанов стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Агаев, Агаджанов, Агасиев. Все они образованы от имён, содержащих компонент «ага», который в тюркских языках часто становился частью личного имени, а не отдельным титулом. В русской традиции к таким именам механически добавляли фамильный суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Агажанов). Поэтому носитель фамилии — это буквально «потомок Агажана».

Интересно, что фамилия Агажанов не имеет однозначной географической привязки: она встречается и у татар, и у народов Кавказа, и у среднеазиатских этносов, что говорит о широкой распространённости самого имени Агажан. В документах XIX — начала XX века фамилия фиксировалась в разных губерниях Российской империи, но чаще всего — среди мусульманского населения, где была сильна традиция двухосновных имён. В отличие от более частых вариантов вроде Агаева, форма Агажанов сохранила полную структуру имени без усечения, что делает её более прозрачной для этимологического разбора.