Фамилия Ахажанов образована от казахского мужского имени Ахажан. В основе этой фамилии лежит типичная для тюркских языков модель: к личному имени добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Ахажана»). Само имя Ахажан, скорее всего, является фонетическим вариантом более распространённого тюркского имени Агаджан. Оно составное: первая часть «ага» означает «старший, уважаемый человек», а вторая — «джан» (в переводе с персидского — «душа», «жизнь»). Таким образом, имя Агаджан (и его вариант Ахажан) можно истолковать как «старшая душа» или «почтенный духом». В традиционной семье такое имя нередко давали первенцу, старшему сыну, подчёркивая его будущую роль и ответственность.

Менее вероятная, но существующая версия связывает имя Ахажан с армянским мужским именем Агаджан. В этом случае его переводят на русский язык как «горец», от армянского «ага» — «гора». Однако для фамилии с казахскими корнями и характерным тюркским суффиксом -ов первая версия выглядит убедительнее. Фамилия Ахажанов встречается преимущественно в Казахстане и среди казахов, проживающих в приграничных регионах России, что подтверждает её тюркское происхождение.