Фамилия Аитова — редкий случай, когда основу можно связать с тюркским словом, а не с русским именем или прозвищем. Исходное слово — турецкое ait, то есть «относящийся, принадлежащий». Казалось бы, абстрактное значение, но в ономастике такие корни обычно превращались в прозвище: Аит могли дать человеку, который был чьим-то приближённым, домочадцем или, наоборот, ничьим — «сам себе принадлежащий». Впрочем, не исключён и более простой путь: Аит — это вариант мусульманского имени Айит (Айет), что значит «знамение, чудо». Тогда фамилия образована от полной формы имени по русской модели: Аит + -ов(а).

Главная особенность фамилии — её география. Самая яркая фигура — Давид Александрович Аитов (1852, Оренбург — 1933). Оренбург в XIX веке был пёстрым в этническом и сословном отношении городом: казаки, купцы, татары, башкиры. Аитов-старший, судя по тому, что сын учился в военной гимназии, а потом в Михайловском артиллерийском училище в Петербурге, принадлежал к разночинной или обедневшей дворянской среде. Сам Давид Александрович пошёл по революционной стезе: сблизился с народниками С. Кравчинским и Л. Шишко, участвовал в «хождении в народ» в Орловской губернии. Там он познакомился с Александром Маликовым и увлёкся его религией «богочеловечества». Арест нашумевшего «Процесса 193-х», высылка в Оренбург, побег за границу в 1879 году — типичная биография радикала-семидесятника.

Суффикс -ов- в фамилии Аитова — стандартный русский патронимический формант, который в женском варианте даёт окончание -а. Это значит, что предок носителя фамилии (по мужской линии) носил имя или прозвище Аит. В дворянской среде такие фамилии закреплялись раньше, чем у крестьян, но точное время возникновения рода Аитовых можно установить только по архивным документам — метрикам, ревизским сказкам. Известно, что в Оренбурге и Поволжье фамилия встречается и сейчас, причём часто у людей с тюркскими корнями, что подтверждает версию о заимствованном тюркском слове в основе.