Фамилия Айдова — яркий пример того, как географическое положение предков может быть зашифровано в родовом имени. Вопреки возможному интуитивному предположению, её корни не в русском, а в тюркском мире. Основа фамилии — топоним или гидроним Айда (Айды). В Поволжье и Приуралье так называли несколько небольших рек, а также селения, стоящие на них. Человек, переселившийся с реки Айды или из села Айдово, получал прозвище Айд, а его дети уже записывались как Айдовы.

Суффикс -ов в окончании указывает на стандартную русскую модель образования фамилий по принадлежности («чей?» — «Айдов»). Однако сама основа Айд- — тюркского происхождения. В башкирском, татарском и казахском языках слово «ай» означает «луна», а «айды» (или «айда») — «лунный», «светлый», «сияющий». В этом случае фамилия могла изначально быть прозвищем: Айд — человек со светлым лицом или родившийся в полнолуние. Но для фамилии Айдова более вероятна именно топонимическая версия — указание на место, откуда родом первый носитель.

Женская форма Айдова — это исходная, грамматически правильная форма для замужней женщины или дочери. Мужской вариант фамилии — Айдов. Это нередкий случай, когда фамилия бытует преимущественно в «женском» облике из-за того, что в документах чаще фиксировали женщин (например, в метрических книгах). Встречается она в основном в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане, что подтверждает её региональную привязку к Волго-Уральскому региону.

Интересна орфографическая особенность: фамилия пишется через «о» (Айдова), а не через «а» (Айдава), что закрепляет ударение на первом слоге. Это отличает её от возможных однокоренных фамилий вроде Айдаров, где корень другой — от имени Айдар. В случае с Айдовой мы имеем дело не с личным именем, а с прозвищем или названием места, что делает её более редкой и уникальной в ономастическом плане.