Фамилия Айдина интересна тем, как на стыке двух языков — тюркского и славянского — возникла необычная словообразовательная конструкция. В её основе лежит тюркское имя Айдын (Aydın), которое в турецком и азербайджанском означает «светлый», «просвещённый» или «ясный». В XIX–XX веках это имя часто давали мальчикам, желая им ума и ясного пути; в Турции и Закавказье оно популярно до сих пор.

К имени добавили русский фамильный суффикс -а. Это редкая модель для русских фамилий: суффикс -а почти всегда указывает на украинское или южнорусское происхождение. В украинской традиции так оформляли фамилии от имён и прозвищ: Шевченко → Шевченка, Грицько → Грицька. Айдина, скорее всего, возникла именно в среде, где тюркское имя адаптировали по украинской модели. Первый носитель фамилии мог быть сыном человека по имени Айдын, которого в документах записали как «Айдина» — буквально «чей? — Айдина».

Географически фамилия встречается в основном на юге России: в Краснодарском крае, Ростовской области и в Крыму. Это зона активных контактов русских и украинских переселенцев с тюркским населением. Не исключено, что фамилия могла возникнуть и в среде греков Приазовья или армян, которые тоже использовали тюркские имена. В отличие от фамилий на -ов/-ев (Айдынов), форма Айдина сохранила «необрусевшее» окончание — её не подогнали под стандартную патронимическую модель, а оставили как есть. Эта деталь и делает фамилию особенно интересной для историка ономастики: она показывает, что в некоторых семьях предпочитали не русифицировать фамилию, а сохранить её в той форме, в какой её впервые записали.