Фамилия Акенева — редкий случай, когда основа явно не славянская, а тюркская или арабская, но оформлена по русской модели. Чтобы это понять, достаточно взглянуть на суффикс: «-ев» указывает на принадлежность, отвечает на вопрос «чей?». В русской традиции так образовывали фамилии от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или, что реже, на «й». Значит, в основе лежало прозвище или имя А́кень, А́кен или Аке́н.

Самая вероятная версия — происхождение от мужского имени Акен, которое является вариантом арабского Аким (Хаким) — «мудрый», «справедливый». В тюркских языках, особенно в казахском и татарском, звук «х» часто выпадает или заменяется на «к», поэтому Хаким легко превращался в Акым, Акен. Фамилия Акенева тогда означает «потомок (жена, дочь) Акена». Это типичная картина для фамилий татарского или башкирского происхождения, которые появились у русских после присоединения Поволжья и Приуралья.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза. В некоторых говорах «акень» могло быть прозвищем человека, который часто употреблял слово «акать» или делал что-то с приставкой «а-» (например, акать в смысле «говорить нараспев»). Но эта версия слабая, потому что прозвища с таким корнем редки, а фамилия Акенева встречается преимущественно в регионах с сильным тюркским влиянием — например, в Оренбургской области и Башкортостане. Там же фиксируются однокоренные фамилии Акиньев, Акишев, что подтверждает связь с корнем «ак» (белый, чистый) или с именем Акиф.

Таким образом, предки носительницы фамилии Акенева по мужской линии, скорее всего, были тюркоязычными людьми, принявшими православие и обрусевшими. Фамилия не указывает на конкретное сословие: её могли получить и крестьяне, и служилые татары. Встречается она редко, что делает её ещё более ценной для семейной истории.