Фамилия Акиленко — образец украинской модели на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала главным маркером «казацкой» фамилии на Левобережной Украине. Суффикс -енко тогда означал не столько «сын» (как позже), сколько принадлежность к роду: Акиленко — буквально «потомок Акилы». Но с самим именем Акила не всё однозначно.

Основа Акил- восходит к каноническому крестильному имени Акила. В святцах это имя греческого происхождения (греч. Akylas — «орёл»), которое носил апостол от семидесяти, сподвижник Павла. Однако в народной среде имя быстро обросло просторечными формами. На украинских землях Акила могло перейти в Акило, а затем в уменьшительное Акиленко. Но есть и более прозаичная версия: в южнорусских говорах «акила» — прозвище неловкого, неуклюжего человека. В словаре Даля зафиксировано: «акила — неловкий, неуклюжий человек». Так что первый носитель фамилии мог получить её не по имени святого, а по бытовому прозвищу, которое цеплялось к человеку за его манеру поведения.

Географически фамилия Акиленко гуще всего встречается в Черкасской, Полтавской и Киевской областях — то есть в ядре бывшей Гетманщины. Это косвенно подтверждает, что фамилия оформилась именно в казацкой среде XVII–XVIII веков, когда суффикс -енко массово вытеснял более старые -ович/-евич. В реестрах Запорожского войска и переписях Гетманщины фамилия не прослеживается, но это объяснимо: письменные источники фиксировали скорее старшину, а рядовые казаки и крестьяне не всегда попадали в документы.

У фамилии есть редкий вариант — Акиленков. Это русифицированная форма, которая появлялась при переселении носителей на север или при записи в российских канцеляриях (суффикс -ов вместо -енко). Но основная масса Акиленко так и осталась в пределах Украины, сохранив прозрачную модель и чёткую региональную привязку. Без громких исторических личностей, но с живой народной основой — от имени святого или меткого прозвища.