Фамилия Акмуллаев — редкий случай прямой отсылки к конкретному историческому лицу, а не к обычному прозвищу или ремеслу. В её основе лежит имя знаменитого башкирского и татарского поэта-просветителя XIX века Акмуллы (настоящее имя — Мифтахетдин Камалетдинович Камалетдинов). Само имя Акмулла — это псевдоним, который переводится с тюркских языков как «святой учитель» или «праведный мулла»: «ак» означает белый, чистый, праведный, а «мулла» — служитель культа, учёный человек. Таким образом, Акмуллаев буквально означает «потомок Акмуллы» или «принадлежащий к роду Акмуллы».

Фамилию оформили по русской модели: к тюркскому имени присоединили патронимический суффикс -ев. Это типичный случай для народов Поволжья и Урала, где в XIX–XX веках при создании фамилий по русскому образцу за основу брали имя или прозвище отца. Суффикс прямо указывает на родственную связь: сын, внук или более дальний потомок человека, которого звали Акмуллой.

Географически фамилия почти наверняка привязана к юго-востоку Башкортостана и прилегающим районам Оренбургской области. Именно там, в деревне Туксанбай (ныне Миякинский район), родился и жил поэт. Среди его земляков и почитателей фамилия могла возникнуть как дань уважения, а не только как прямое указание на кровное родство. Встречается она и у татар, и у башкир, но в целом остаётся очень редкой.

Возможна и более прозаичная версия, хотя и менее вероятная: фамилия могла возникнуть не от имени знаменитого поэта, а от прозвища какого-то другого грамотного и уважаемого муллы в конкретном ауле. В этом случае Акмуллаев — не «копия» с известной фамилии, а независимое образование, просто совпавшее по звучанию. В любом случае основа одна: предок носителя фамилии был человеком, которого в народе называли «святым учителем» или «чистым муллой», что говорит о его высоком моральном авторитете и образованности.