Фамилия Акушкины — типичная русская фамилия, образованная от имени, которое носил предок. В её основе лежит имя Акушка, народная, обиходная форма двух разных крестильных имён: Иаков (в русском быту — Яков) и Иоаким (Аким). Яков в переводе с древнееврейского означает «пятка» или «идущий по пятам», а Иоаким — «бог поставил», «бог утвердил». Оба имени были широко распространены, так что Акушкой в разных семьях могли называть и Якова, и Акима.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Акушкин — это «сын Акушки» или «человек из семьи Акушки». Такая модель — одна из самых распространённых в русской фамильной системе, особенно в северных и центральных регионах.

Существует и другая гипотеза, менее убедительная, что фамилия восходит к тюркскому имени Акуш, означающему «белая птица» или «лебедь». Однако для русской среды типичнее образование от православных календарных имён через уменьшительные формы. В пользу этого говорит и то, что фамилии на -ин от имён на -а, -я — массовое явление, а тюркские заимствования в этой модели встречаются реже.

О точном месте и времени возникновения фамилии Акушкины говорить сложно: процесс становления фамилий в разных слоях населения шёл с XV по XIX век. Но ясно одно: перед нами не прозвище по ремеслу или внешности, а именно отчество в третьем поколении, закрепившееся и передавшееся дальше.