Фамилия Алагулова — женская форма мужской фамилии Алагулов, и её происхождение почти наверняка ведёт в тюркский мир. Основа «Алагул» или «Алагол» составная: «ала» (пёстрый, рябой, а в переносном смысле — хитрый, коварный) и «гул» («кул» — раб, слуга, но в антропонимии часто — «раб божий», человек). В тюркских языках такие имена-прозвища давали, чтобы уберечь ребёнка от сглаза: назвав его «пёстрым рабом», родители старались сделать его незаметным для злых сил.

Формант «-ов» указывает на русскую модель образования фамилий: к основе Алагул добавили русский суффикс принадлежности, превратив имя в родовое прозвание. Встречается также вариант «Алагулов» с ударением на второй слог, что характерно для башкирской и татарской среды, где фамилии часто оканчиваются на «-ов», но произносятся с тюркской интонацией.

Географически фамилия Алагулова наиболее часто встречается в Башкортостане и соседних регионах Урала и Поволжья. Это не случайно: в башкирской ономастике немало имён с компонентом «ала» (Алабай, Алакай, Алагул). Носители фамилии, скорее всего, потомки башкир, татар или мишарей, которые в XIX веке получили фамилии по отцовскому имени, когда указом 1828 года начали массово фиксировать родовые прозвания у нерусского населения.

В отличие от многих фамилий, где корень однозначно ясен, здесь возможен и второй, менее вероятный вариант: от тюркского «алагул» — разведчик, дозорный, передовой воин (от «ала» — в значении «передний» и «гул» — рука, сила). Но эта версия спорная: в словарях древнетюркских титулов такое слово не зафиксировано, и большинство исследователей склоняются к имени-оберегу.

Сословная принадлежность предков Алагуловых, скорее всего, была крестьянской или военно-служилой (у башкир и татар были свои сословные группы — тептяри, бобыли, служилые татары), но точных данных без генеалогического исследования нет. Фамилия не дворянская, не купеческая — она из народной, бытовой среды, где имя давали по примете или по характеру.