Фамилия Алексутин образована не напрямую от полного имени Алексей, а через цепочку уменьшительных форм, что сразу выделяет её на фоне более распространённых Алексеевых или Алексиных. В основе лежит крестильное имя Алексей (от древнегреческого «алексиос» — «защитник»), которое в быту превратилось в Алексуту. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей сын?» — сын Алексуты. Такая словообразовательная модель с суффиксом -ута типична для северных и центральных русских говоров, где ласкательные окончания вроде Ванюта, Петрута были в ходу. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще закреплялись за служилым сословием, -ин был характерен для крестьянской и мещанской среды, особенно в документах XVII–XVIII веков.

Первый носитель фамилии, вероятно, был либо сыном человека по прозвищу Алексута, либо сам носил это имя в быту. Суффикс -ута мог придавать уменьшительно-пренебрежительный оттенок — так могли назвать младшего члена семьи или человека небольшого роста, хотя со временем этот оттенок стёрся. Фамилия редкая и географически привязана к регионам активного заселения в XVI–XVII веках: встречается в документах по Рязанской, Тамбовской и Нижегородской губерниям, но массового распространения не получила.

В некоторых говорах Алексута могло быть не столько уменьшительным, сколько прозвищем за характер — от диалектного глагола «алексутить» (хитрить, льстить). Эта версия менее надёжна, так как основа всё же восходит к имени, но она показывает, как простое имя обрастало неожиданными смыслами. Фамилия Алексутин хранит след той эпохи, когда личное имя в быту сокращали до неузнаваемости, а потом записывали в ревизские сказки уже как фамилию.