Фамилия Аление с первого взгляда ставит в тупик: окончание «-ие» для русских фамилий настолько нетипично, что сразу выдаёт в ней не исконную, а книжную или искусственную форму. В русской ономастике почти нет фамилий на «-ие» — стандартные суффиксы «-ов», «-ев», «-ин», «-ский». Такое окончание характерно для прилагательных среднего рода вроде «явление», но в фамилиях оно практически не встречается. Это наводит на мысль о происхождении в среде духовенства или дворянства под влиянием латинского или греческого языка.

Самая обоснованная версия: Аление — русифицированная форма латинского alenus или производного от греческого ἀλήνης (alēnes), что означает «чужой, пришлый, странник». В семинарской среде было принято переводить русские фамилии на латынь или греческий, а потом адаптировать обратно. Например, фамилия Пришелец могла превратиться в Аление. Другие версии куда слабее. Если бы основа была связана с прилагательным «алый» (красный), фамилия скорее выглядела бы как Алин, Алов или Алёнов. Форма «Аление» для такого корня грамматически нелогична и нетипична.

Географически фамилия почти не встречается в исторических переписях — в дореволюционных списках и современных базах она единична, что говорит о позднем и, вероятно, единичном происхождении. Скорее всего, носители сосредоточены в центральной России или на юге, где были сильны семинарские традиции. Если предок носил эту фамилию, он мог быть выходцем из духовного сословия — священником или дьяком, получившим фамилию при поступлении в семинарию.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает редкость модели. Есть фамилия Аленев (от имени Алён или прозвища Аленя), но она образована по типичному суффиксу «-ев». Аление стоит особняком. Если отбросить семинарскую версию, остаётся лишь маловероятное предположение, что это опечатка или искажение при записи — например, от Алиев или Аленкин, но без документальных подтверждений это гадание. Поэтому наиболее обоснованным остаётся книжное, искусственное происхождение фамилии с корнем, означающим «чужеземец» или «странник».