Фамилия Алениус — редкий пример фамилии латинского происхождения, закрепившейся в русской культурной среде. Её основа — латинское слово alenius, которое в классической латыни означает «принадлежащий к другому роду» или «чуждый». Однако в российской ономастике эта фамилия почти всегда связана с духовным сословием. В XVIII–XIX веках выпускники семинарий и академий нередко получали «искусственные» фамилии на -ус, -ий, -евский, которые переводили их мирские прозвища или фамилии на латынь. Алениус могла возникнуть как латинизированная форма от фамилии Алёнин или Алёнов, образованной от имени Алёна (производное от Елена). Семинаристам часто давали фамилии, созвучные греческим или латинским корням, чтобы подчеркнуть образованность.

Суффикс -ус — характерный маркер «семинарской» фамилии. В отличие от крестьянских фамилий на -ов/-ев, -ин, такие окончания указывали на книжное происхождение. Если носитель фамилии Алениус — потомок священнослужителя, то его предок, скорее всего, учился в духовном училище или академии, где получил эту фамилию при поступлении или выпуске. Встречается она преимущественно в центральных губерниях России, где были сильны традиции духовного образования, — например, в Ярославской, Костромской, Владимирской.

Есть и более редкая версия: фамилия могла возникнуть от прозвища Алёна (через форму Алёниус) без связи с латынью, но тогда она бы писалась как Алёниус или Алениус с ударением на первый слог. Однако в документах XIX века ударение чаще фиксируется на второй слог — Алениус, что подтверждает латинскую модель. Сравните с однокоренными фамилиями: Аленин, Алёнин — они проще и бытовее, а Алениус стоит особняком, как знак принадлежности к образованному сословию.

В современной России фамилия крайне редкая. Поиск по базам данных показывает единичные случаи в Москве и Санкт-Петербурге, что логично: потомки духовенства после революции часто уезжали в крупные города. Если вы носите эту фамилию, ваши предки с высокой вероятностью были связаны с церковной средой — либо как священники, либо как учителя семинарий.