Фамилия Алениус — характерный пример «семинарской» фамилии, искусственно созданной в духовной среде. В XVIII–XIX веках выпускники семинарий и академий нередко получали фамилии на -ус, -ий, -евский, чтобы перевести их мирские прозвища или фамилии на латынь. Основа здесь — латинское слово alenius, которое в классической латыни означает «принадлежащий к другому роду» или «чуждый». Однако в российской ономастике значение почти всегда вторично: фамилия возникла как латинизированная форма от русской фамилии Алёнин или Алёнов, образованной от имени Алёна (производное от Елены). Семинаристам давали такие созвучные латинским корням фамилии, чтобы подчеркнуть образованность.

Суффикс -ус — главный маркер книжного происхождения. В отличие от крестьянских фамилий на -ов/-ев, -ин, такие окончания указывали на духовное училище или академию, где фамилию присваивали при поступлении или выпуске. Если носитель фамилии Алениус — потомок священнослужителя, то его предок, скорее всего, учился в центральных губерниях России, где были сильны традиции духовного образования, — например, в Ярославской, Костромской, Владимирской. Именно там фамилия встречалась чаще всего.

Есть и более редкая версия: фамилия могла возникнуть от прозвища Алёна (через форму Алёниус) без связи с латынью, но тогда она бы писалась как Алёниус или Алениус с ударением на первый слог. Однако в документах XIX века ударение чаще фиксируется на второй слог — Алениус, что подтверждает латинскую модель. Сравните с однокоренными фамилиями: Аленин, Алёнин — они проще и бытовее, а Алениус стоит особняком, как знак принадлежности к образованному сословию.

В современной России фамилия крайне редкая. Поиск по базам данных показывает единичные случаи в Москве и Санкт-Петербурге — потомки духовенства после революции часто уезжали в крупные города. Если вы носите эту фамилию, ваши предки с высокой вероятностью были связаны с церковной средой: либо как священники, либо как учителя семинарий.