Фамилия Аликсеева — один из тех редких случаев, когда написание расходится с привычным слуху вариантом. Если вы ищете информацию о ней, то сразу заметите: на слух она звучит как Алексеева, но пишется через «и». Это не ошибка и не описка, а реально существующая, хоть и малочисленная, фамилия.

Разбираем её по составу. Основа — «Аликсе-» плюс суффикс -ев и окончание -а (для женского рода). Суффикс -ев указывает на принадлежность: чей? — Аликсеев. Мужской вариант фамилии — Аликсеев. Сама основа, скорее всего, восходит к крестильному имени Алексей (от греческого «алексиос» — защитник). Почему же не «Алексеев»? Тут возможны два объяснения. Первое: диалектное произношение. В некоторых русских говорах, особенно на севере и в центральных областях, безударное «е» после мягкого согласного могло звучать как «и» — так называемое «иканье». Записывали фамилию со слуха: слышали «Аликсеев» — так и писали. Второе, менее вероятное: влияние редкого неканонического имени или прозвища Аликса (возможно, сокращение от Александр или Алексей с другим суффиксом).

Географически фамилия Аликсеева встречается крайне редко, в основном в центральной России и Поволжье. По социальному происхождению — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, образованная от имени отца. Предки человека с такой фамилией, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, которых в документах записали «по-простому», как слышали. В дворянских родословных книгах эта фамилия не фиксируется — там строго держались за каноническое написание Алексеевы.

Сравните с однокоренными: есть ещё фамилии Алексиев, Алексиков, Алексанов — все они от того же имени, но с разными суффиксами. Аликсеева же стоит особняком: она как бы «фонетическая сестра» привычной Алексеевой, но с собственной историей письменной фиксации. Если вы носитель этой фамилии, то у вас, скорее всего, предки из тех мест, где не слишком следили за орфографией при записи в метрические книги, а полагались на слух.