Фамилия Алимситова — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной, а мужской вариант «Алимситов» встречается в справочниках гораздо реже. Такая фиксация могла произойти из-за особенностей документирования в конкретной местности или передачи фамилии по женской линии. Сама основа «Алимсит» скорее всего восходит к личному имени Алим (араб. ‘алим — «знающий», «учёный»), широко распространённому у татар, башкир и народов Кавказа. Нестандартный для русских фамилий суффикс -сит, вероятно, возник из тюркского компонента -сыт/-сит, который в некоторых диалектах оформляет принадлежность или происхождение — например, в казахском и татарском языках форма «Алимсыт» означала бы «принадлежащий Алиму», «из рода Алима». При адаптации к русской грамматике конечное -т осмыслили как часть основы, и фамилию записали через -ов: Алимситов, а затем и Алимситова.

Вероятный путь образования: тюркское прозвище или именование Алимсыт («потомок Алима») → русская фамилия Алимситов → женская форма Алимситова. Носители фамилии, скорее всего, имеют тюркские или кавказские корни, а сама фамилия сложилась в среде, где русские окончания смешивались с местными именными моделями — типичная картина для Поволжья, Урала или Северного Кавказа в XIX веке. Географически фамилия встречается крайне редко: единичные записи фиксируются в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области, что подтверждает её локальное происхождение. Сословно предки могли быть крестьянами или мещанами, но из-за малочисленности фамилии точных сведений нет. Алимситова не входит в списки дворянских родов и не описана в классических ономастических словарях, но для её носителей это уникальный маркер происхождения из определённого этнического и географического ареала.