Фамилия Алипбеков — классический пример того, как тюркское составное имя «приживили» к русской паспортной системе с помощью суффикса -ов. Её основа — мужское имя Алипбек, которое складывается из двух частей: «Алип» и «бек». Первая часть восходит к арабскому имени Али (علي), одному из самых распространённых в исламском мире, означающему «возвышенный», «великий». Форма «Алип» характерна для казахского, каракалпакского и некоторых других тюркских языков: конечный звук «и» перешёл в «ы» или «ип». Вторая часть — «бек» (тюрк. «господин», «князь», «правитель»). В составе сложных имён «бек» указывал на знатное происхождение или высокое положение, а мог служить и пожеланием ребёнку стать влиятельным человеком. Имя Алипбек означает «господин Али» или «великий бек», подчёркивая и религиозный, и социальный статус.

Распространена фамилия преимущественно у казахов, встречается у киргизов и каракалпаков. Суффикс -ов, а не -ев, присоединён к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный «к»: Алипбек → Алипбеков. Это стандартная для XIX–XX веков адаптация тюркских фамилий в русской паспортной системе. В среде самих тюркских народов фамилия могла бы звучать как Алипбеков, а в некоторых регионах — без суффикса, просто Алипбек, что до сих пор встречается в качестве личного имени.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Алипбеков вряд ли относились к высшей аристократии — суффикс -ов обычно получали при записи в метрики рядовые кочевники и крестьяне, а не султаны и торе (прямые потомки Чингисхана), которые часто сохраняли родовые имена без русификации. Однако сам корень «бек» указывает, что предок носителя фамилии, вероятно, принадлежал к уважаемому роду или занимал должность старшины, бия или батыра. В казахской ономастике имя Алипбек нередко давали в честь деда или прадеда, так что фамилия могла закрепиться за целым аулом или отделением рода, где это имя было особенно почитаемо.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Алиев, Алимов, Беков, Бекмуратов) показывает, что Алипбеков — более редкая и локальная форма, не получившая массового распространения за пределами Средней Азии. Встречаются варианты написания с одной «п» — Алибеков, что иногда вносит путаницу, но в этимологически правильной записи сохраняется двойная согласная, отражающая стык корней «Алип» и «бек». Именно этот стык — самая характерная черта фамилии: она буквально «сшита» из двух полновесных смыслов, и двойное «п» в написании — не опечатка, а след того, что имя собирали, а не сокращали.