Фамилия Аллахинов — редкий случай в русском ономастиконе, где основа напрямую восходит к арабскому слову «Аллах» (Бог). Вопреки возможному впечатлению, это не религиозное прозвище в прямом смысле, а производное от личного имени Аллах, которое бытовало у тюркских и кавказских народов, исповедующих ислам. В дореволюционной России такие имена нередко давали детям в семьях татар, башкир, азербайджанцев или народов Дагестана, подчеркивая принадлежность к вере, но без сакрального запрета на использование имени Всевышнего в быту — в тюркской традиции «Аллах» могло быть частью составного имени (например, Аллахверди — «Бог дал») или самостоятельным.

Суффикс -ов указывает на русскую модель фамилизации, характерную для крещёных или обрусевших носителей тюркских фамилий. В XIX—XX веках, при переходе в православие или при записи в метрических книгах, к основе на согласный добавляли стандартное окончание -ов, реже -ин. Таким образом, Аллахинов буквально значит «потомок того, кого звали Аллах» или «принадлежащий роду Аллаха». Фамилия могла закрепиться за муллой, учителем медресе или просто человеком, чьё имя было воспринято как родовое.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью (Татарстан, Башкортостан) и Северному Кавказу, но встречается и у русских, имеющих тюркские корни по мужской линии. Интересно, что в отличие от фамилий типа Аллахов или Аллаховский, форма «Аллахинов» встречается реже — возможно, из-за того, что исходное имя могло иметь вариант Аллахин (с тюркским суффиксом принадлежности -ин), а затем обрусело до Аллахинов. В словарях фамилия не фиксируется как широко распространённая, что делает её ценным маркером конкретного рода, а не массового сословия.

С точки зрения звучания, фамилия сохраняет ударение на втором слоге (Алла́хинов), что типично для русских фамилий на -инов, образованных от имён с ударением на последний слог основы. В быту её иногда путают с более частотной фамилией Аллахинов, но орфографическая разница (одна «х» против двух) принципиальна: двойное «х» могло возникнуть при записи от руки или под влиянием арабского написания, где буква «ха» удваивается. Впрочем, большинство носителей пишут фамилию с одной «х», и это считается нормой.