Фамилия Алони — одна из тех, что ломают привычную русскую модель. В ней нет суффиксов -ов, -ин, -ский, которые обычно указывают на принадлежность («чей?»). Это неадаптированная фамилия, которая пришла в русский язык уже в готовом виде, скорее всего, из иврита или арабского. Поэтому искать её корни в древнерусских прозвищах или ремёслах неверно: перед нами фамилия, географически и культурно связанная с Ближним Востоком и еврейской диаспорой.

Самая прямая версия: Алони — это топонимическая фамилия, образованная от названия израильского кибуца Алони (или Алоней). Таких поселений в Израиле несколько, и все они восходят к слову «алон» (אלון) — «дуб». Дуб в еврейской традиции — символ силы, долголетия и связи с землёй, поэтому название кибуца выбрано не случайно. Соответственно, носитель фамилии Алони — это человек, чьи предки жили в таком месте или были связаны с ним. В русском языке фамилия могла закрепиться при переезде, например, в ходе репатриации или эмиграции.

Вторая версия, менее распространённая, но лингвистически возможная — связь с арабским словом «алван» (الوان) — «цвета». В этом случае фамилия могла бы указывать на занятие красильщика или торговца тканями. Однако эта гипотеза слабее: переход «алван» в «Алони» требует дополнительного фонетического сдвига, который не объясняется простым заимствованием. К тому же, в арабском мире фамилия Алони встречается реже, чем в еврейской среде, где она документирована.

Обратите внимание на окончание: -и в русском языке для такой фамилии — не суффикс, а часть основы. Это отличает её, скажем, от фамилии Алонов, где -ов уже русский патронимический суффикс. Если бы предок носителя звался Алоном (от греческого имени или прозвища), фамилия звучала бы как Алонов. Алони же — это именно «человек из Алони», что подтверждает её топонимическую природу.

В русских документах фамилия Алони встречается с конца XX века, чаще всего у людей, переехавших из Израиля или стран бывшего СССР с еврейскими корнями. Географически она привязана к крупным городам, где есть еврейские общины: Москва, Санкт-Петербург, Одесса. Сословной истории в Российской империи у неё нет — это фамилия, которая появилась в русском языке уже в советское или постсоветское время.