Фамилия Андрюхины происходит от имени Андрей, а точнее — от его народной, обиходной формы Андрюха. Греческое имя Андрей означает «мужественный, храбрый», и эта же характеристика перешла на производное прозвище. Такая модель образования — от краткого или уменьшительного имени через суффикс -ин — одна из самых распространённых в русской ономастике. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Андрюхин, то есть сын, потомок Андрюхи.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в центральных и южных регионах, фамилии на -ин типичны для северных и северо-восточных земель Древней Руси, а также для Поволжья. Поэтому можно предположить, что корни Андрюхиных — где-то в этих краях, хотя точное место возникновения фамилии сейчас установить трудно: процесс закрепления фамилий шёл несколько столетий, и одно и то же прозвище могло независимо появиться в разных местах.

Интересно, что имя Андрей дало целое гнездо родственных фамилий: Андреев, Андреянов, Андрианов, Андрюшин, Андрющенко. Андрюхины стоят в этом ряду особняком благодаря редкому суффиксу -юх-: он характерен для просторечных, «домашних» форм имён (ср. Митюха от Дмитрий, Матюха от Матвей). Такая форма могла закрепиться за конкретным человеком, который в своей среде был известен именно как Андрюха — возможно, из-за простого происхождения или дружеского обращения.

Несмотря на кажущуюся простоту фамилии, за ней стоит живая история: когда-то давно жил человек по имени Андрюха, и его дети стали писаться Андрюхиными. Фамилия не исчезла, а сохранилась до наших дней как памятник русской антропонимии — науки о том, как и почему люди получают свои родовые имена.