Фамилия Анфилофье — редкий пример того, как церковное имя, пройдя через народную речь и канцелярскую запись, приобрело почти неузнаваемый облик. В её основе лежит крестильное имя Анфилохий (греч. Amphilochios — «окружённый засадой» или, по другой версии, «тот, кто ставит засаду»). В просторечии это длинное имя неизбежно сокращалось: отбрасывался конец, и возникали формы вроде Анфилох, а затем и Анфилоф — с характерной для русского языка заменой конечного «х» на «ф» (ср. Филипп вместо Philippos или Парфён вместо Parthenios). Такая замена — не случайность, а живой фонетический процесс: глухой «х» на конце слова звучал неустойчиво и переходил в более отчётливый «ф», особенно в говорах, где цокали и путали согласные.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Анфилофьев буквально означало «сын Анфилофа». Со временем одна буква «в» в окончании могла выпасть при произношении или в документах, закрепившись в форме Анфилофье. Это типичный случай усечения патронимического суффикса, который встречается в фамилиях на -ев, особенно в южнорусских говорах и в среде бывших однодворцев. Однодворцы — особая группа служилых людей, которые несли сторожевую службу на южных рубежах и часто искажали церковные имена в документах, сокращая их до минимума. Возможно, именно в их среде Анфилох сначала стал Анфилом, а потом и Анфилофом.

География фамилии узкая. Основные очаги — Рязанская, Тамбовская и Воронежская области, то есть регионы, где в XVII–XVIII веках селились служилые люди и церковнослужители. Носители Анфилофьевых, скорее всего, происходили из среды причетников или мелкого духовенства: имя Анфилохий было особенно популярно среди священников и дьячков. В крестьянской среде оно встречалось реже — слишком книжное и длинное. Примечательно, что в тех же метрических книгах XIX века имя Анфилохий нередко записывали как «Анфилофей» — это промежуточная форма, которая и дала начало фамилии. Священники, привыкшие к греческим календарям, произносили имя по-книжному, а прихожане переиначивали на свой лад, и в итоге в документах закреплялся именно народный вариант.

В отличие от более распространённых Анфимовых или Анфиногеновых, фамилия Анфилофье сохранила архаичный вариант основы, который уже в XIX веке воспринимался как необычный. В метрических книгах XIX века можно встретить колебания в написании: Анфилофьев, Анфилофьевский, а иногда и просто Анфилов — последнее могло быть результатом упрощения. Сегодня Анфилофье — фамилия нечастая, но именно её редкость и делает её надёжным маркером рязанско-тамбовских корней. Если встретите носителя этой фамилии, почти наверняка его предки — выходцы из тех мест, где в XVII веке звенели сабли однодворцев и читали псалтыри дьячки.