Фамилия Антаков образована от прозвища или некалендарного имени Антак — украинской народной формы имени Антон, которое, в свою очередь, восходит к полному церковному имени Антоний. В основе лежит греческое слово anteo — «вступать в бой, состязаться». Таким образом, предок носителя фамилии Антаков, скорее всего, звался Антаком, а его потомки получили фамилию по стандартной восточнославянской модели: к основе на твёрдый согласный прибавили суффикс -ов, означающий принадлежность («чей?» — сын Антака).

Сам по себе суффикс -ов в фамилии Антаков указывает, что она оформилась в среде, где говорили на русском или украинском литературном языке и делопроизводстве, — в отличие от чисто украинских фамилий на -енко или -ук. Однако корень Антак выдает южнорусское или украинское происхождение. В украинской традиции имя Антон часто сокращали до Антко, Антак, Антух, а фамилии на -ак (Грицак, Стецак) особенно типичны для западноукраинских земель.

В православных святцах известно несколько святых с именем Антоний. Среди них — преподобный Антоний Римлянин, который, согласно житию, родился в Риме в 1067 году в богатой православной семье, а впоследствии основал монастырь в Новгороде. Другой известный покровитель — Антоний Печерский, основатель Киево-Печерской лавры. Однако прямого отношения к фамилии Антаков эти биографии не имеют: имя стало популярным задолго до того, как закрепились фамилии, и выбор святого покровителя был делом семьи, а не фамильной традиции.

Географически фамилия Антаков встречается нечасто, но её очаги — преимущественно юг России, Украина и смежные регионы. Встречаются варианты написания Антаков и Антаков — ударение, скорее всего, падает на второй слог. Родственные фамилии: Антонов, Антонцев, Антаков, Антюхов, Антушев. Все они восходят к одному имени, но разными путями: через разные суффиксы и диалектные формы.