Фамилия Антакова образована от прозвища Антак, которое восходит к литовскому слову antakis — «бровь». Скорее всего, такое прозвище мог получить человек либо с густыми бровями, либо с рассеченной бровью. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Антак, со временем получил фамилию Антакова.