Фамилия Антинина — женская форма от Антинин, а та, в свою очередь, образована от крестильного имени Антоний. Казалось бы, всё просто, но в русской народной традиции полное церковное имя «Антоний» почти не употреблялось в быту. Вместо него в ходу были краткие и разговорные варианты: Антон, Антя, Антип и — реже — Антиня. Именно от формы Антиня (уменьшительной или простонародной версии Антония) и возникла основа фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Антинин буквально значит «сын Антини» или «человек из семьи Антини». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Сравните: Ильин, Кузьмин, Фомин. Здесь тот же механизм, только основа менее привычная на слух.

Важный нюанс: Антиня — не путать с Антипой. Имя Антип (от греческого «против всех») давалось отдельно, и от него пошли фамилии Антипов, Антипин. Антиня же — это именно ласкательная или диалектная форма Антония, распространённая в северных и центральных губерниях России. Встречается она реже, чем Антон или Антоха, поэтому и фамилия Антинина — нечастая.

Поскольку форма женская, носительница фамилии — прямая потомница по отцовской линии того самого Антини. Предок мог быть крестьянином, ремесленником или священником — имя Антоний и его производные встречались во всех сословиях, без жёсткой социальной привязки. Единственное, что можно сказать наверняка: в основе лежит живое, разговорное имя, а не книжное, что выдаёт в предке человека из простонародной среды, где официальное полное имя заменяли домашним прозвищем.

Фамилия Антинина встречается в основном в европейской части России, особенно в бывших Новгородской и Вологодской губерниях, где диалектная форма Антиня была наиболее употребительна. В других регионах её можно спутать с фамилией Антипина, но это разные корни.