Фамилия Антишин образована от имени Антиша — уменьшительной формы крестильного имени Антипа. В переводе с греческого Антипа означает «противник всего». Это имя носил один из семидесяти апостолов, священномученик Антипа Пергамский, почитаемый в православии как целитель. Со временем потомок человека по имени Антиша получил фамилию Антишин.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность, отвечая на вопрос «чей?». Антишин — буквально «сын Антиши» или «человек из рода Антиши». Этот патронимический суффикс типичен для русских фамилий, образованных от основ, оканчивающихся на -а или -я, что и дало форму Антишин, а не, скажем, Антипов (от полной формы Антипа).

Само имя Антипа в народной среде давало множество производных: Антипка, Антиша, Антиш. Последний вариант встречается в документах XVI–XVII веков, например, в переписных книгах Новгородской земли. Интересно, что фамилия Антишин географически тяготеет к южнорусским и среднерусским областям — Тамбовской, Рязанской, Воронежской губерниям, где имя Антипа было особенно распространено.

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с диалектным словом «антипа» — так в некоторых говорах называли упрямого, спорщика. Однако в случае с Антишиным первичным, скорее всего, остаётся крестильное имя, поскольку уменьшительная форма Антиша встречается в церковных записях чаще, чем прозвище.