Фамилия Апполинаров — редкий случай, когда написание напрямую диктует произношение. Двойное «п» в корне — не ошибка и не вариант фамилии Аполлинаров, а попытка сохранить в письменном виде греческое удвоение согласной в имени Ἀπολλινάριος (Аполлинарий). В церковной и дореволюционной традиции такое написание встречалось, хотя в быту фамилию могли записывать и с одной «п». В основе лежит каноническое мужское имя Аполлинарий (в просторечии — Апполинарий), которое в переводе с латыни означает «посвящённый Аполлону» или «солнечный». Суффикс -ов указывает на типичную модель русских фамилий XIX века: сын Апполинария, то есть потомок человека, носившего это имя.

Фамилия эта почти наверняка семинарская. В среде духовенства, особенно в XVII–XIX веках, было принято давать детям «говорящие» имена из святцев, и Аполлинарий — одно из них. Святых с таким именем несколько, самый известный — Аполлинарий Равеннский, епископ II века. Однако в крестьянской и купеческой среде имя встречалось редко из-за своей длины и книжного звучания. Поэтому Апполинаровы — это, скорее всего, потомки либо священников, либо дьячков, либо выходцев из духовного сословия, получивших фамилию при поступлении в семинарию.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России, где было сильно влияние церковных школ. Встречается и в украинских землях, но там чаще писали через одно «п» — Аполлинаров. Двойное «пп» — это маркер именно великорусского, книжного произношения и поздней фиксации в метриках.

Сравните с однокоренными фамилиями: Аполлонов, Аполлонский — те же корни, но с другим суффиксальным оформлением. Аполлонов — более редкая, обычно тоже семинарская, а Аполлонский — уже явно искусственная, образованная по модели «на -ский» (как Троицкий, Рождественский). Апполинаров стоит особняком: двойное «п» делает её более узнаваемой, хотя и менее распространённой.

Если говорить о социальном контексте: в XIX веке носитель фамилии Апполинаров мог быть сельским священником, учителем церковно-приходской школы или причетником. Фамилия не дворянская и не купеческая — она из той среды, где имя давали по святцам, а фамилию — по имени отца, без претензий на знатность.