Фамилия Аполинарьев — одна из тех, что сразу выдают книжное, церковное происхождение. В её основе лежит редкое крестильное имя Аполинарий. В святцах оно связано с двумя святыми: Аполинарием Равеннским и Аполинарием Александрийским. Само имя — греческое, и тут есть развилка: одни возводят его к «аполлими» (губить), другие — к имени бога Аполлона, что даёт значение «посвящённый Аполлону». Какая версия правдоподобнее — вопрос спорный, но для истории фамилии важнее другое: имя это в русском быту было книжным, не народным, и встречалось почти исключительно в церковной среде. Отсюда и редкость фамилии.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: сын Аполинария. Но здесь интересна форма: мы говорим Аполинарьев, а не Аполинариев. Основа имени оканчивается на мягкий согласный «рь», и в устной речи двойной гласный «ий» стянулся, дав современное написание. В дореволюционных метриках можно встретить вариант Аполинариев, но он ещё реже. Это хороший пример того, как живая речь упрощает книжную форму.

Имя Аполинарий иногда путали с Поликарпом или Аполлинарием, но корни у них разные. В народе могли переосмыслить имя как «поле» или «полынь», но для фамилии это маловероятно — книжное происхождение держалось крепко, и фамилия не обросла бытовыми вариантами.

Географически Аполинарьевых чаще всего можно встретить в центральной России и на северо-западе — там, где были сильны церковные приходы. Носители фамилии — потомки священников, дьячков или людей, получивших имя по святцам. Среди дворянства фамилия не зафиксирована: Аполинарий не было «родовым» именем аристократии. По данным переписей, фамилия малочисленная, что подтверждает её элитарность в смысле редкости, а не социального статуса. Если вы встретили её в своей родословной, скорее всего, предки были связаны с церковью или получили имя в честь святого, почитаемого в конкретной местности.