Фамилия Апратов — одна из тех, где корень на первый взгляд кажется ясным, а при ближайшем рассмотрении даёт простор для споров. Чаще всего её связывают с греческим именем Апрат, которое в православных святцах встречается в форме Апраксий. Это имя носил один из семидесяти апостолов, и в русской традиции оно давало целое гнездо фамилий: Апраксин, Апратов, Апратьев. Суффикс -ов указывает на типичную модель «чей?» — то есть сын или потомок человека по имени Апрат. Такая версия самая прямая и подкреплена тем, что у фамилии есть знаменитый «родственник» — графский род Апраксиных.

Но есть и вторая линия, менее парадная, зато более бытовая. В южных и западных говорах слово «апрат» или «апратый» могло означать «опрятный», «прибранный», «чистый». Это диалектное прилагательное, родственное литературному «опрятный». Если так, то прозвище Апрат давали аккуратному хозяину, человеку, который следит за порядком в доме и одежде. Прозвища по внешним или бытовым чертам — один из самых массовых источников русских фамилий, так что эта версия не менее правдоподобна, чем календарная.

Что интересно: в XIX веке фамилия Апратов встречается в основном в двух регионах — в Курской губернии и на Дону. В Курской губернии, где были сильны малороссийские говоры, слово «апратний» (опрятный) употреблялось активно. А на Дону, где селились выходцы из разных областей, фамилия могла закрепиться и по именной, и по прозвищной модели. География подсказывает, что прозвищная версия для Апратовых из Черноземья весомее.

Словообразовательный суффикс -ов — стандартный патронимический, самый частый в русских фамилиях. Он не несёт дополнительной сословной окраски: Апратовыми могли быть и крестьяне, и мещане, и священники. Дворянской ветви с такой фамилией не зафиксировано, в отличие от Апраксиных. Так что обладатель фамилии Апратов с высокой вероятностью ведёт род от человека по имени Апрат (из святцев) или от прозвища Апрат, данного за опрятность. Обе версии рабочие, и окончательный выбор зависит от того, в какой местности жили предки.