Фамилия Аптраева — редкий случай, когда географический и этнический след просматривается почти сразу, а вот точное значение исходного слова остаётся под вопросом. В основе фамилии лежит мужское имя или прозвище Аптрай, которое в русском языке не встречается ни в святцах, ни в древнерусских летописях. Это надёжный маркер того, что корни фамилии не славянские, а тюркские, скорее всего татарские или башкирские.

Фамилия образована по самой распространённой русской модели — притяжательным суффиксом -ев, который присоединяют к основе, оканчивающейся на согласный или -й. Аптрай + ев = Аптраев. Женская форма Аптраева возникла как естественное грамматическое производное. Такая модель в тюркских фамилиях на территории бывшей Российской империи встречается сплошь и рядом: русские писцы и чиновники «переводили» местные имена и прозвища в привычную форму фамилий на -ов/-ев.

Теперь о самом имени Аптрай. Самая вероятная версия — это диалектный или сокращённый вариант арабского имени Абдрахман (или Абдурахман), что в переводе означает «раб Милостивого» (одно из имён Аллаха). В тюркской среде сложные арабские имена часто усекали для удобства произношения: Абдрахман → Аптрахман → Аптрай. Если это так, то фамилия восходит к религиозному имени, популярному у мусульман Поволжья и Приуралья. Менее убедительная, но возможная версия — связь с тюркским словом «аптрау» (в некоторых диалектах — «удивляться», «теряться»), тогда прозвище Аптрай могли дать человеку рассеянному или простодушному. Однако первая версия, с религиозным именем, выглядит правдоподобнее, потому что прозвища с таким корнем почти не фиксируются в ономастических источниках.

Географически фамилия Аптраева тяготеет к Башкортостану и прилегающим областям (Оренбургская, Челябинская). Это неудивительно: именно в этих краях распространены фамилии от усечённых форм арабских имён. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках носители фамилии, скорее всего, записаны как тептяри или башкиры-вотчинники — сословия, которые платили ясак и несли военную службу, но не были крепостными. Таким образом, предки современной семьи Аптраевых, вероятно, жили на Южном Урале или в Закамье, исповедовали ислам и носили имя, которое при русификации превратилось в фамилию.