Фамилия Ардаханова — женская форма, а её основа, фамилия Ардаханов, образована от мужского личного имени или прозвища Ардахан. Разбираем её по тюркским корням: «арда» в татарском, башкирском, казахском означает «честь», «достоинство» (реже — «тыл», «задняя часть»), а «хан» — верховный правитель. Складывается в «почётный хан» или «хан чести».

Скорее всего, это не имя реального средневекового правителя, а прозвище, которое дали человеку за авторитет, гордый нрав или уважение в общине. В тюркской среде составные имена с «хан» встречались часто: Тимурхан, Айхан, Бекхан. Ардахан — вариант более редкий, что выделяет фамилию.

Русский суффикс «-ов» указывает на модель, по которой в XVI–XIX веках оформляли прозвания тюркских народов, вошедших в состав империи. Ардахановы — потомки человека по имени Ардахан. Географически фамилия чаще встречается у татар, башкир и народов Северного Кавказа (кумыков, ногайцев), где тюркские имена с титулом «хан» сохранялись дольше.

Есть менее вероятная версия — связь с топонимом Ардахан (город и провинция на востоке Турции). Тогда фамилию могли получить выходцы оттуда. Но для русской фамильной системы типичнее отчество от личного имени, а не от названия города, поэтому первая гипотеза убедительнее.

В дореволюционных записях фамилию могли писать через «ъ» (Ардахановъ) или с удвоенной «н» — Ардаханнов, но корень оставался неизменным. Носители — в основном потомки служилых татар, казаков или крестьян, получивших фамилию при переписях XIX века.