Фамилия Атаманская — редкий пример фамилии, которая почти наверняка ведет начало не от прозвища предка, а от конкретного географического названия. Основа — топоним Атаманово, село в Сухобузимском районе Красноярского края. История этого села известна: в 1650 году отряды казаков по приказу красноярского воеводы Петра Протасьева поставили первые избы на берегу Енисея, и поселение назвали в честь основателей — атаманов Тюменцевых. Вероятно, предок носителей фамилии родился или жил именно в Атаманово, а фамилию ему дали по месту жительства.

Суффикс -ск- указывает на принадлежность к местности: Атаманская — «та, что родом из Атаманово». Такая модель типична для дворянских и казачьих фамилий, но в Сибири ее нередко получали и простые переселенцы, записанные по селу. Женская форма фамилии (Атаманская, а не Атаманский) говорит о том, что в исходном документе фамилия была закреплена за женщиной или что она перешла по женской линии — в русской традиции такие фамилии не склоняются по роду, а остаются в форме, данной при записи.

Вторая версия — связь с прозвищем Атаман, то есть с казачьим чином. Атаманы составляли высшее сословие Войска Донского, и прозвище могли дать за храбрость или за командную должность. Однако эта гипотеза слабее: от прозвища Атаман обычно образовывали фамилии Атаманов или Атаманкин, а форма на -ский почти всегда привязана к топониму. Кроме того, конкретная привязка к селу Атаманово с известной датой основания делает географическую версию более убедительной.

Фамилия Атаманская — нечастая. Ее носители, скорее всего, потомки сибирских казаков или крестьян, осевших в Приенисейском крае в XVII–XVIII веках.