Фамилия Атаманюк образована от прозвища Атаман. В основе этого прозвища лежит нарицательное «атаман» — предводитель шайки, вольницы; затем — выборный, старшина, глава казачьей общины. Таким образом, фамилия содержит указание на должность или социальное положение предка. Атаман — это цвет казачества, высшее сословие войска, поэтому прозвище могло закрепиться за человеком, который занимал эту должность или обладал соответствующими лидерскими качествами. Позже прозвище Атаман, изначально присоединенное к наследственному имени, полностью заменило его как в повседневной жизни, так и в официальных документах.

Фамилия Атаманюк интересна своим суффиксом. В отличие от распространённых на востоке Украины фамилий на -енко (Атаманенко), суффикс -юк типичен для западных регионов — Волыни, Подолья, Галиции. Это указывает на то, что предок носителя фамилии жил именно на западе украинских земель. В словообразовательной модели суффикс -юк выполнял роль патронимического показателя, то есть «Атаманюк» буквально означало «сын Атамана» или «потомок Атамана». Сравните с другими фамилиями той же модели: Гнатюк, Степанюк, Романюк. Таким образом, по фамилии можно с высокой вероятностью определить регион происхождения рода.