Фамилия Авидын — редкая и неочевидная по происхождению. Её ядро — корень «авид-», который может восходить к двум разным источникам: к церковному имени Авдий (от древнееврейского «служитель Бога»), утратившему конечное «-ий» в бытовом произношении, или к старославянскому прилагательному «авидынъ» — «явный, открытый, известный». Вторая версия менее вероятна, так как прилагательные редко становились основой для русских фамилий, но полностью её исключать нельзя: в говорах слово «авидный» могло означать «видный, заметный человек».

Фамилия образована по типичной для восточнославянских земель модели с суффиксом -ын. Это вариант суффикса -ин, который присоединялся к основам на -а: Авида → Авидын. Если в основе лежало имя Авдий, то сначала появилось прозвище или некалендарное имя Авида (усечённая форма, как Ива́н от Иоанн), а затем от него — фамилия, отвечающая на вопрос «чей?»: сын Авиды.

В документах фамилия почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании. Вероятнее всего, она возникла в южнорусских или украинских областях, где усечение церковных имён было особенно распространено (Авдий → Авида, как Аггей → Агей). Носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьянской или мещанской среды, где фамилии закрепились поздно — в XVIII–XIX веках.

Стоит учесть и вариант написания через «о» — Авдын. В устной речи аканье могло превратить «о» в «а», и на письме закрепился именно такой вариант. Если встречаете обе формы, это один корень.

Однокоренных фамилий немного: Авдеев, Авдиенко, Авдийчук — все они идут от того же имени Авдий, но с разными суффиксами. Авидын стоит особняком из-за редкого суффикса -ын, который в украинской традиции встречается чаще, чем в великорусской.