Фамилия Автончук — хороший пример того, как украинская модель словообразования накладывается на имя, которое само по себе прошло долгий путь изменений. В основе лежит крестильное имя Автон, которое в православных святцах встречается в форме Автоном (от греческого «автономос» — независимый, живущий по своим законам). В народной речи имя сократили до Автон, отбросив конец, как это часто делали с длинными именами. Суффикс -чук — типичный для западноукраинских и белорусских земель (Волынь, Полесье, Подолье). Он означает «маленький» или «сын», то есть Автончук — это буквально «сын Автона» или «Автонов внук».

В отличие от более частых фамилий на -енко, которые распространены по всей центральной и восточной Украине, -чук крепко держится на западе. Поэтому носители фамилии Автончук, скорее всего, родом из Волынской, Ровенской или Житомирской областей. В России фамилия встречается редко и, как правило, занесена переселенцами с Украины в XIX–XX веках.

Интересно, что имя Автоном в народе иногда переосмысливали и связывали со словом «автомобиль» (тогда ещё «автомобиль»), но это позднее и шуточное сближение. Настоящий корень — греческий, с идеей самостоятельности. В документах XVII–XVIII веков на Волыни встречаются записи крестьян и казаков с именем Автон, что подтверждает бытование этой формы в живой речи.

В написании фамилии возможны варианты: Автончук и изредка Овтончук (через «о» — следствие аканья в некоторых говорах). Но закрепилась литературная форма через «а». Сословно фамилия указывает на крестьянское или мещанское происхождение — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.