Фамилия Автончук — наглядный пример того, как украинская модель словообразования накладывается на имя, прошедшее долгий путь изменений. В её основе лежит крестильное имя Автон — народная сокращённая форма от канонического Автоном (от греческого «автономос» — независимый, живущий по своим законам). В живой речи длинное имя просто отбросило окончание, как это часто делали с Автономом, Силуаном или Корнилием. Суффикс -чук — типичный для западноукраинских и белорусских земель (Волынь, Полесье, Подолье). Он означает «маленький» или «сын», то есть Автончук — буквально «сын Автона» или «Автонов внук».

В отличие от фамилий на -енко, которые распространены по всей центральной и восточной Украине, -чук крепко держится на западе. Поэтому носители фамилии Автончук, скорее всего, родом из Волынской, Ровенской или Житомирской областей. В документах XVII–XVIII веков на Волыни встречаются записи крестьян и казаков с именем Автон, что подтверждает бытование этой формы в живой речи. В России фамилия встречается редко и, как правило, занесена переселенцами с Украины в XIX–XX веках.

Интересно, что имя Автоном в народе иногда переосмысливали и шуточно связывали со словом «автомобиль», но это позднее сближение. Настоящий корень — греческий, с идеей самостоятельности. В написании фамилии возможны варианты: Автончук и изредка Овтончук (через «о» — следствие аканья в некоторых говорах), но закрепилась литературная форма через «а». Сословно фамилия указывает на крестьянское или мещанское происхождение — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.