Фамилия Аймалидинов образована от имени Аймалидин, которое является фонетическим вариантом имени Джамалетдин. Оно состоит из двух частей: «джамал» и «дин». Первая из них в переводе с арабского означает «красивый, добрый». Вторая часть имени Джамалетдин означает на арабском «религия, вера». Таким образом, именование Джамалетдин можно трактовать как «совершенство религии». Таким образом, потомок человека, которого звали Аймалидин, со временем получил фамилию Аймалидинов. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.