Фамилия Бабаркина — женская форма фамилии Бабаркин. Её основа — прозвище или нецерковное имя Бабарка. В русской ономастике суффикс -ин указывает на принадлежность: Бабаркин буквально значит «сын Бабарки» или «человек из семьи Бабарки». Мужской вариант образован по той же модели, что и десятки тысяч русских фамилий от прозвищ и имён на -а/-я.

Само слово «бабарка» — редкое и диалектное. В говорах Русского Севера (архангельских, вологодских, пермских) бабаркой называли небольшую деревянную лопаточку или весёлку для размешивания теста, а также широкий нож для рубки капусты. Если прозвище возникло от этого значения, предок мог быть пекарем, поваром или просто человеком, которого за сходство с этим предметом так прозвали.

Есть и другая, менее бытовая версия: «бабарка» может быть уменьшительно-пренебрежительной формой от «баба» — то есть женщина, старуха. В этом случае прозвище давали либо старшей женщине в роду, либо мужчине, который жил при жене или нянчился с детьми. Такие прозвища на Руси не считались обидными — они фиксировали бытовую роль или особенность.

Фамилия Бабаркина не принадлежит к числу дворянских или распространённых купеческих. Скорее всего, она крестьянская, и её носители жили в северных и центральных губерниях России. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного прозвища в конкретной деревне или волости.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то рядом стоят Бабарин, Бабаров, Бабаев. Но Бабаркин выделяется суффиксом -к-, который часто добавляли к прозвищам с оттенком уменьшительности или иронии. Это не просто «сын Бабы», а скорее «сын Бабарки» — человека, которого в округе знали под этим бытовым, может быть, даже шутливым именем.