Фамилия Бабатовы — один из тех случаев, когда за простой на вид основой скрывается несколько версий, и каждая по-своему объясняет, откуда пошёл род. Спорят здесь не столько о корне, сколько о том, через какой язык и в какое время он приобрёл фамильную форму.

Самый очевидный и часто повторяемый вариант — от персидского мужского имени Баба, что значит «отец» или «батюшка». Такое имя было распространено у многих тюркских народов, и в XV–XVII веках, когда выходцы из Золотой Орды, печенеги и половцы входили в состав русского дворянства, их имена становились основой для фамилий. Если держаться этой версии, Бабатов — потомок человека, которого звали просто и уважительно: Отец.

Но есть и более тонкий разбор, который учитывает суффикс. Имя Бабат могло образоваться от тюркского Баб (господин, хозяин, богатырь) или Баба при помощи суффикса -т. В осетинском языке этот суффикс указывает на множественное число, а в некоторых кавказских диалектах — на принадлежность к месту. Не исключено, что в основе лежит название древнего поселения Бабиат в Северной Осетии: Баби (вариант имени Баба) плюс -ат со значением «место». То есть Бабиат — «место жительства Бабы», а фамилия Бабатов — указание на выходца оттуда.

Реже встречается версия, что Бабат — прозвище. В русских говорах «бабаня» — ласковое обращение к бабушке, и Бабатом могли назвать бабушкиного воспитанника или любимца. В нижегородских говорах слово «бабан» имело иное значение — «бабник», но такое толкование для фамилии выглядит натянутым и обычно отбрасывается.

Что объединяет все эти версии, так это восточное происхождение основы. Фамилия Бабатовы — независимо от того, считать ли её тюркской, персидской или кавказской — явно не из славянского именослова. А суффикс -ов, привычный для русских фамилий, лишь «обрусел» на новом месте, привязав родовое имя к стандартной модели.