Фамилия Бабитинский — яркий пример того, как географическое название превращается в фамилию. Её основа — топоним, скорее всего, название населённого пункта вроде Бабитино или Бабитин. Такие деревни и сёла встречались в западных и центральных губерниях Российской империи: в Смоленской, Витебской, Минской или на Волыни. Суффикс -ский в таких фамилиях указывает на происхождение: «тот, кто родом из Бабитина» или «владелец имения Бабитино». В польской и белорусской традиции этот суффикс был особенно распространён среди шляхты, но на практике его носили и крестьяне, переселившиеся в другие места и получившие прозвище по бывшему месту жительства.

Корень «бабит-» восходит к слову «баба». В славянской ономастике это могло означать и женщину, и прозвище робкого или женоподобного мужчины, и даже языческое имя-оберег. Однако в случае с фамилией на -ский вероятнее, что первичен именно топоним: поселение могли назвать по имени или прозвищу основателя (например, некий Бабита). Форма «Бабита» — редкая, но возможная: от «баба» с уменьшительным суффиксом -ит, как «Святополк» → «Святополка» или «Кузьма» → «Кузьмит». Либо название деревни пошло от речки или урочища, где водилось много баб (птиц) или стоял камень-«баба».

В отличие от массовых фамилий вроде Бабин или Бабкин, Бабитинский — редкая и более поздняя по образованию. Она не фиксируется в ранних боярских списках и не встречается в «Ономастиконе» Веселовского. Скорее всего, она оформилась в XVII–XIX веках, когда крестьяне и мещане, получая фамилии при переписях, брали название родной деревни. Носители фамилии сегодня рассеяны по России, Украине и Беларуси, но наибольшая концентрация — в областях, граничащих с Польшей и Литвой, что подтверждает западное происхождение.

Есть и менее вероятная версия: от прозвища «Бабита» — так могли называть человека, который любил ухаживать за женщинами или, наоборот, был подкаблучником. Но в таком случае ожидалась бы фамилия Бабитин (с суффиксом -ин), а не Бабитинский. Поэтому топонимическое объяснение надёжнее.