Фамилия Бабонины — редкий случай, когда одно и то же прозвище могло возникнуть из совершенно разных жизненных ситуаций. В её основе лежит прозвище Бабоня, и у этого слова как минимум два серьёзных объяснения.

Первая версия отсылает к глаголу «бобонити» — старинному слову, означавшему «шуметь», «болтать», «говорить без умолку». Если верить этой гипотезе, Бабоней в русских деревнях могли прозвать болтливого человека, любителя поболтать или покричать. Такие прозвища по характеру давали часто и охотно.

Вторая версия — бытовая и более прозрачная. Слово «бабоня» в некоторых говорах (особенно южных и западных) было ласковым обращением к бабушке или вообще к пожилой женщине. Но прозвище мог получить и мужчина — например, «бабушкин внук», то есть ребёнок, которого воспитывала бабушка, или её любимец. Кроме того, в нижегородских говорах бытовало слово «бабан» — так называли любителя женщин, волокиту. Не исключено, что Бабоней могли окрестить и такого персонажа.

Морфологически фамилия образована по стандартной модели: к основе Бабон- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «Бабонин сын», «Бабонина жена»). Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от слов женского рода или от прозвищ на -а/-я, поэтому Бабонины вписываются в обширную группу русских фамилий вроде Дёмин, Фомин, Галкин.

Прямых указаний на сословную принадлежность у фамилии нет. Бабонины могли быть и крестьянами, и посадскими людьми — прозвище Бабоня не несёт социальной окраски. Географически фамилия встречается в центральных и северных областях России, но без массового распространения: это не частая, а скорее редкая фамилия.

Что касается времени возникновения: прозвища активно переходили в фамилии в XV–XVII веках, когда закреплялись за целыми родами. Но точную дату появления именно Бабониных можно установить только по конкретным архивным записям — переписным книгам или метрикам. Без них остаётся лишь реконструировать логику: человек по прозвищу Бабоня, его дети стали писаться Бабониными, и фамилия зажила своей жизнью.