Фамилия Бабонин образована от прозвища Бабоня, которое, вероятно, связано со старинным русским словом «бобонити» в значении «шуметь», «болтать». Соответственно, именование Бабоня могло указывать на особенности характера его носителя. Не исключено, что именование Бабоня образовалось от аналогичного слова, которое представляет собой ласковое обращение к бабушке или вообще к пожилой женщине. Возможно, Бабоней называли воспитанника бабушки или ее любимца. Следует отметить, что в нижегородских говорах существовало слово «бабан», которым называли любителя женщин. Поэтому прозвище Бабоня мог получить и любитель ухаживать за женщинами В старину прозвища нередко вытесняли имена не только в быту, но даже проникали в официальные документы. Так и прозвище Бабоня закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Бабонин.