Фамилия Бабанин отвечает на простой и понятный вопрос: чей? Чей ребёнок, чей внук, чей воспитанник. Ответ — Бабанин, то есть принадлежащий Бабане. А Бабаней в русских говорах ласково называли бабушку. Прозвище Бабаня давали ребёнку, который рос у бабушки, был её любимцем или находился на её попечении. Со временем это прозвище закрепилось за потомком и превратилось в фамилию.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность, как в фамилиях Дедин, Мамин, Тётин. Это одна из древнейших и самых распространённых моделей русских фамилий, образованных от имён и прозвищ родственников. Интересно, что в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще давались по отцу, фамилии на -ин нередко фиксировали связь с матерью или, как в данном случае, с бабушкой.

В некоторых говорах слово «бабаня» могло иметь и другие значения — так называли не только пожилую женщину, но и, например, неуклюжего или медлительного мужчину. Однако основная, самая естественная версия происхождения фамилии — от ласкового именования бабушки. Фамилия встречается в центральных и южных областях России, что совпадает с ареалом бытования соответствующего диалектного слова.

Однокоренные фамилии — Бабанов, Бабушкин, Бабин — все они образованы от разных форм одного корня, но каждая несёт свой оттенок родства. Бабанин стоит в этом ряду особняком: он прямо указывает на бабушку как на главу семьи или ключевую фигуру в воспитании ребёнка.