Бабаней нередко называли бабушку. Следовательно, прозвище Бабанин, отвечающее на вопрос «чей?», мог получить ребёнок, воспитанный бабушкой или её любимец. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бабаня, со временем получил фамилию Бабанин.