Фамилия Бабанюк — яркий пример украинской модели образования фамилий с помощью патронимического суффикса -юк. В восточнославянской ономастике этот суффикс (наряду с -ук, -чук) указывает на происхождение от отца или предка: Бабанюк буквально означает «сын (или потомок) Бабана». Если убрать суффикс, остаётся основа Бабан — прозвище или имя, от которого и пошла фамилия.

Корень здесь — слово «баба». В украинском и южнорусских говорах оно многозначно: это и «женщина», и «бабушка», и «повитуха», и даже «толстая, неуклюжая женщина». Однако прозвище Бабан могло относиться не к женщине, а к мужчине. В народе так могли назвать того, кто много времени проводил с женщинами (например, бабник), либо человека, похожего на старуху внешностью или поведением — сутулого, ворчливого, медлительного. Встречается и версия, что Бабан — производное от имени Бабан (уменьшительное от Борис, Абакум или Вавила), но она менее убедительна, так как в документах XVII–XVIII веков чаще фиксируется именно прозвищная основа.

Географически фамилия Бабанюк плотно привязана к западным и центральным областям Украины, особенно к Волыни, Подолью и Полесью. В России она встречается редко и почти всегда — у выходцев из Украины. Интересно, что в польском языке есть слово babań, означающее «неряха» или «разиня», что могло повлиять на прозвища в зонах польско-украинского пограничья, но для фамилии Бабанюк эта версия второстепенна.

Словообразовательный тип на -юк считается одним из самых продуктивных на западе Украины, особенно среди крестьянского и казацкого сословий. В отличие от русских фамилий на -ов или -ин, которые часто закрепляли за человеком его отца или поместье, украинские фамилии на -ук/-юк чётко указывали на принадлежность к роду: Бабанюк — «из рода Бабана». Так что предки носителя этой фамилии, скорее всего, были простыми людьми: хлеборобами, ремесленниками или казаками, получившими своё родовое имя по меткому бытовому прозвищу.