Фамилия Бабошин имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркского прозвища Бабош. Она образована от турецких слов «baba» -«отец» и «boş» - «свободный». Таким образом, фамилия Бабошин может служить указанием на то, что предок, получивший прозвище Бабош, воспитывался без матери. Возможно, фамилия Бабошин восходит к нарицательному «бабуши» - турецкие туфли без задников. Следовательно, прозвище Бабошин мог получить человек, который носил или шил такие туфли. Из однофамильцев известны композитор XVIII века Андрей Бабошин и инженер Пётр Бабошин, осуществивший в 1780 году перевод работы Иогана Лемана «Рассуждение о фосфорах» на русский язык. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бабоша, со временем получил фамилию Бабошин.