Фамилия Бадунов — одна из тех, что образованы от прозвища или мирского имени, но с неочевидной основой. На первый взгляд, корень «бадун» может показаться тюркским или даже иноязычным, но скорее всего он имеет славянские корни, связанные с диалектным глаголом «бадить» или «бадеть». В русских говорах «бадить» означало медлить, мешкать, а также говорить вздор, пустословить. Человека, который любил поболтать или, наоборот, отличался неторопливостью, могли прозвать Бадуном.

Суффикс -ов в фамилии указывает на типичную русскую модель образования от имени или прозвища отца: Бадун → сын Бадунов. То есть первый носитель фамилии был, скорее всего, сыном некоего Бадуна. Географически фамилия встречается в центральных областях России, а также в Поволжье, что подтверждает её исконно русское происхождение, а не заимствование из тюркских языков, где «бадун» мог бы означать нечто иное.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с календарным именем Вадим. В некоторых диалектах имя Вадим могло трансформироваться в Бадим, а затем в Бадун — через замену начальной буквы и упрощение. Однако эта гипотеза слабая, так как для перехода «Вадим» → «Бадун» нет убедительных фонетических закономерностей в русском языке.

Таким образом, самое правдоподобное объяснение: предок носителя фамилии Бадунов получил прозвище за характер или привычку — был либо говорлив, либо медлителен. Фамилия не относится к числу дворянских или знатных, но и не является редкой: в современных телефонных справочниках и базах данных она встречается с устойчивой частотой, особенно в Нижегородской и Кировской областях.