Фамилия Бадяутдинов — редкий пример того, как арабское имя, пройдя через тюркскую языковую среду, превратилось в русскую фамилию с необычным суффиксом. В основе лежит мужское имя Бадретдин (вариант Бадруддин), что в переводе с арабского означает «полная луна веры» или «луна религии»: «бадр» — полнолуние, «дин» — вера. Звук «р» в середине со временем выпал или перешёл в «й» — так и получилось Бадяутдин. Это типичный процесс адаптации арабских имён в татарской и башкирской среде, где гортанные звуки смягчались или заменялись на более привычные.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов, который в Поволжье и Приуралье часто присоединяли к тюркским основам. Однако здесь любопытен суффикс -утдин: он встречается реже, чем привычные -етдинов или -утдинов. По сути, Бадяутдинов — «сын Бадяутдина», то есть потомок человека, которого нарекли в честь религиозного понятия. Предки носителя фамилии, скорее всего, были мусульманами, жившими на территории современных Татарстана или Башкортостана, и принадлежали к сословию государственных или ясачных крестьян, реже — к духовенству.

Встречается фамилия в основном в Татарстане и Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в соседних областях. Из-за редкости она почти не фиксируется в дореволюционных переписях, зато попадается в советских метрических записях 1920–1930-х годов. Однокоренные фамилии — Бадретдинов, Бадрутдинов, Бадертдинов — распространены шире, но Бадяутдинов выделяется специфической звуковой формой, которая выдает местный говор: в некоторых татарских диалектах «р» перед «д» переходит в «й» или исчезает вовсе.

С точки зрения словообразования это фамилия-патроним, но не от крестильного имени, а от мусульманского теофорного имени, что указывает на конфессиональную принадлежность предков. Никакого дополнительного прозвища или ремесла за ней не стоит — только имя, данное при рождении. Если искать параллели в русской среде, то Бадяутдинов стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Хайрутдинов или Валиутдинов, но с более выраженной диалектной окраской.