Фамилия Бадрутдинова образована от мужского мусульманского имени Бадрутдин. Это составное имя арабского происхождения: первая часть, «бадр», означает «полная луна» или «совершенство», а вторая, «дин», переводится как «вера». Вместе имя Бадрутдин осмысляется как «полная луна веры» — образное пожелание, чтобы человек сиял чистотой и глубиной своей веры, подобно полной луне.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе имени Бадрутдин добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -а). Такая модель характерна для фамилий, которые начали массово оформляться у тюркских и кавказских народов, исповедующих ислам, в конце XIX — начале XX века, когда царская администрация и церковные метрики требовали закрепления наследственного родового имени. То есть предок носителя фамилии, скорее всего, звался Бадрутдином, а его дети и внуки стали Бадрутдиновыми.

Имя Бадрутдин — не редкое в мусульманском мире, особенно среди татар, башкир и народов Северного Кавказа. Поэтому фамилия Бадрутдинова распространена в Татарстане, Башкортостане, а также в регионах Поволжья и Урала, куда переселялись татары. Встречаются и варианты написания — Бадрутдинов, иногда с заменой «д» на «т» в середине под влиянием произношения, но корень остаётся тем же.

Процесс формирования фамилий у разных народов шёл неравномерно, и точно определить место и время возникновения конкретного рода Бадрутдиновых можно только по генеалогическим документам — ревизским сказкам, метрическим книгам или записям мечетей. Но сама фамилия надёжно хранит память о предке, которого назвали в честь «полной луны веры», что говорит о религиозной и культурной традиции семьи.