Фамилия Бакакин образована от прозвища Бакака, восходящего к тюркскому слову «бак», которое переводится на русский язык как «смотрящий». Скорее всего, данное прозвище указывало на профессию предка. Так, свои смотрящие были в постоялых дворах, больницах, других государственных учреждениях. Возможно, прозвище Бакака получил человек, который вел с нее наблюдение. Следует отметить, что Бакакины — это дворянский род, известный с XVI века. Его основателем является Иван Митрофанович Бакака-Карачаров, служивший дворцовым дьяком в 1537 - 1549 годах. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бакака, со временем получил фамилию Бакакин.