Фамилия Баканова — женская форма фамилии Баканов, которая образовалась от прозвища Бакан. В основе этого прозвища лежит несколько версий, и самая убедительная связана с ремеслом. Словом «бакан» на Руси называли красильный лак, чаще всего багряную краску, которую добывали из червца и марены. Поэтому прозвище Бакан мог получить художник, иконописец или красильщик тканей. Эту версию подтверждают документальные источники: фамилия Баканов была особенно распространена среди «богомазов» (иконописцев) из Шуи, Палеха и Иванова. Самый известный носитель этой профессии — Иван Михайлович Баканов (1870–1936), художник палехской лаковой миниатюры.

Есть и другие объяснения. Прозвище Бакан могло восходить к древнетюркскому слову «бакан» — «кольцо» (металлическое), и тогда его давали ремесленнику, который делал кольца. Либо к тюркскому же «бакан» в значении «столб, шест» — в таком случае основатель рода отличался высоким ростом и худощавым телосложением. Какая из этих версий верна для конкретной ветви, сказать трудно, но первая — ремесленная — подкреплена и географией, и известными личностями.

В письменных источниках прозвище Бакан встречается с XVI века. В «Ономастиконе» академика С. Б. Веселовского записан Бакан Дмитриевич Тютчев, живший в Зубцове в ту эпоху. Потомки человека с таким прозвищем и получили фамилию Бакановы.

Среди носителей фамилии, упомянутых в Памятных книгах, — Алексей Васильевич Баканов (1887 г. р.) из деревни Плаксово Вологодской области, занесённый в Книгу памяти Алма-Атинской области; Григорий Васильевич Баканов (1875 г. р.) из хутора Крутинский Ростовской области; зажиточный крестьянин Григорий Миронович Баканов (1886 г. р.) из села Налеткино Спасского района, записанный в Книгу памяти Республики Татарстан. Из известных однофамильцев — писатель, историк и краевед Владимир Петрович Баканов (1924–2007).